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Genómica, estudios preclínicos y clínicos como herramientas para la medicina personalizada en Distrofias de retina

Resumen del proyecto

Objetivos: Profundizar en el estudio de las Distrofias de Retina (DR): a) Sus bases moleculares, esclareciendo mecanismos no descubiertos hasta ahora con las técnicas NGS, mediante la aplicación de nuevas y distintas aproximaciones genómicas, bioinformáticas y funcionales; b) Sus aspectos clínicos: mediante la correlación genotipo-fenotipo y estudios de historia natural de la enfermedad (HNE); c) trasladar este conocimiento a la práctica clínica, mediante algoritmos o guías para el diagnóstico, pronóstico y tratamiento de los pacientes y sus familias (modelos celulares pre-clínicos y ensayos clínicos). Metodología: Entre >3000 familias (6000 pacientes) afectas de DR no sindrómica y sindrómica (excepto Sd. de Usher) se seleccionarán: A) Casos no caracterizados, en los que se aplicarán nuevos enfoques NGS y herramientas y algoritmos de análisis genómico: A.1 mediante paneles (exoma clínico+ filtrado, MIPS y otros) de genes conocidos e implicados en DR A.2 Mediante WES y WGS para la identificación de nuevos genes en los casos no caracterizados. A.3 Diseño de nuevas pipelines informáticas para guiar el filtrado de las variantes y para identificar grandes reordenamientos genómicos (del/dup). B) Casos parcial o completamente caracterizados, en los que se realizarán estudios epidemiológicos, clínicos (HNE) y funcionales. B.1 estudios funcionales (CRISPR/Cas9, iPSC, minigenes y técnicas bioquímicas). B.2.Estudios de HNE en cohortes de pacientes con mutaciones conocidas. B.3. Preselección de casos para inclusión en EECC en curso. El Subproyecto 2 (JM. Millán) aplicará idénticos objetivos y metodología al estudio del Sd. de Usher (USH) desarrollando modelos celulares y murinos (CRISPR/Cas9) para mutaciones en USH2A y caracterizando este modelo. El Subproyecto 3 (D. Lukovic) establecerá modelos celulares humanos (iPSC de pacientes) como herramienta para esclarecer mecanismos de DR y escrutinio terapéutico.

Palabras clave

células madre pluripotentes inducidas
iPSC
secuenciación masiva
NGS
secuenciación del exoma completo
WES
secuenciación del genoma completo
WGS
historia natural de la enfermedad
HNE

Periodo de ejecución

01/01/2017 - 31/12/2019

Investigador Principal

AYUSO GARCIA, CARMEN

Centro beneficiario

FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA FUNDACION JIMENEZ DIAZ

Centro de realización

FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA FUNDACION JIMENEZ DIAZ

Comunidad Autónoma

MADRID

Provincia

MADRID

Financiación

264.082 €

® Instituto de Salud Carlos III