Los objetivos de presente trabajo son: 1) Identificar la influencia de genes de las rutas de señalización de los sensores de ácidos nucleicos en diferentes condiciones inflamatorias patológicas: infección viral crónica (hepatitis C) y enfermedades con componente mayoritariamente autoinmune (lupus eritematoso sistémico, SLE), autoinflamatorio (enfermedad de Crohn, CD) y mixto (enfermedad de Behçet, BD). 2) Determinar la influencia de las variantes génicas identificadas en el objetivo anterior en la expresión del propio gen y de los productos finales de estas rutas de señalización. 3) Identificar variantes genéticas causales relacionadas con la función de la proteína y/o con la expresión génica que expliquen la asociación con las patologías. Para alcanzar estos objetivos realizaremos: 1) genotipado mediante tecnología MALDI-TOF de SNPs previamente seleccionados en HapMap en pacientes y controles. Establecimiento de haplotipos con Haplowiew. Comparación de frecuencias en pacientes y controles. 2) Estudio de expresión de mRNA mediante PCR a tiempo real de los genes incluidos en el objetivo 1 y de los productos finales de las rutas. Comparación de expresión en las muestras no estimuladas y estimuladas con 3 análogos diferentes de ácidos nucleicos estratificadas por genotipos. 3) Secuenciación masiva de regiones asociadas en 100 controles y pacientes de la patología de que se trate con la plataforma MySeq de Illumina. Confirmación de variantes asociadas mediante genotipado con sondas Taqman del resto de la cohorte de pacientes y controles.
inmunidad innata
autoinmunidad
01/01/2014 - 30/09/2017
GONZALEZ ESCRIBANO, MARIA FRANCISCA
FUNDACION PUBLICA ANDALUZA PARA LA GESTION DE LA INVESTIGACION EN SALUD EN SEVILLA
INSTITUTO DE BIOMEDICINA DE SEVILLA - IBIS
ANDALUCIA
SEVILLA
150,040 €