La finalidad del proyecto es identificar genes implicados en la predisposición germinal al síndrome de poliposis serrada (SPS), una nueva forma de alto riesgo de cáncer colorrectal (CCR). La identificación de estos genes permitiría el diagnóstico genético predictivo. La correlación con las variables clínicas permitirá establecer un subgrupo de pacientes CCR, facilitando su identificación posterior en la población, así como implantar medidas de prevención y tratamiento específicas. --Objetivos-- 1. Secuenciación de exoma germinal en familias con SPS. 2. Secuenciación de exoma somático en CCR y pólipos serrados. 3. Análisis de datos filtrando y priorizando a nivel germinal y somático. 4. Identificación de genes candidatos para la predisposición germinal al SPS. 5. Validación por secuenciación Sanger. 6. Estudio de segregación en miembros adicionales. 7. Análisis de expresión de genes candidatos validados. 8. Evaluación de la relevancia clínica y el valor predictivo y pronóstico de las mutaciones identificadas para identificar un subgrupo de pacientes con características diferenciadas. --Metodología-- Pacientes: 20 familias con SPS. Secuenciación exoma: SureSelectXT Human All Exon de Agilent y HiSeq de Illumina. Filtrado y priorización de los resultados de secuenciación: Filtrado de 2 eventos mutacionales y por funcionalidad mediante pipelines automatizadas. Análisis de CNV a partir de los datos NGS. Validación de variantes candidatas: secuenciación Sanger, CGH, estudios de segregación, análisis somático. Estudios funcionales: ARN germinal/somático con PCR a tiempo real y arrays. Expresión proteica con Western blot e inmunohistoquímica. Análisis relevancia clínica: correlación del estado mutacional con las características demográficas, clínicas y relativas al tumor, y el pronóstico.

biomedicina
genética humana
genética molecular
cáncer colorrectal hereditario
cáncer colorrectal hereditario familiar
secuenciación de nueva generación