La finalidad del presente proyecto de investigación es identificar nuevos genes de susceptibilidad a las poliposis adenomatosas de origen no filiado, mediante la secuenciación de exomas en familias. Estos pacientes presentan alto riesgo a desarrollar cáncer colorrectal (CCR) y la identificación de nuevos genes permitirá la realización de test genéticos diagnósticos y predictivos que facilitarán el seguimiento clínico y prevención del CCR en estos pacientes y sus familiares. OBJETIVOS: 1. Selección de familias recogidas en EPIPOLIP, en función de la edad de diagnóstico, número de adenomas y familiares afectados. 2. Secuenciación completa de exomas y priorización de genes candidatos siguiendo las estrategias de análisis desarrolladas en PI11/00681. 3. Establecer el papel potencial de los genes candidatos como nuevos genes de susceptibilidad al desarrollo de adenomas colorrectales múltiples: estudios de segregación en familias, análisis de mutaciones somáticas en tumor, validación en cohortes más amplias con el mismo fenotipo clínico. 4. Evaluar la relevancia clínica de las variantes genéticas identificadas en función de las características demográficas, clínicas y relativas al tumor. METODOLOGÍA: .-Pacientes: 20 familias con adenomas colorrectales múltiples (10-100), edad de diagnóstico menor de 60 años, 1 ó 2 familiares afectos. .-Secuenciación de exomas: Ion Proton o SOLID 5500XL. .-Filtrado, priorización y validación de variantes genéticas: pipelines automatizadas (frecuencia, impacto funcional,coincidencia en familias, expresión …) y secuenciación Sanger. .-Caracterización de genes: mutaciones somáticas (LOH, secuenciación panel NGS), segregación en familias y validación en cohorte adicional (secuenciación panel NGS). .-Análisis de relevancia clínica: correlación de la variante con las características clínicas.
adenomas
cáncer colorrectal
CCR
exomas
variantes genéticas
poliposis
predisposición genética a la enfermedad
01/01/2015 - 31/12/2017
RUIZ PONTE, CLARA
FUNDACION RAMON DOMINGUEZ
INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA DE SANTIAGO DE COMPOSTELA (IDIS)
GALICIA
LA CORUÑA
99,220 €