La caracterización molecular de los aislados de Mycobacterium tuberculosis (MTB) ha mejorado nuestro conocimiento de sus dinámicas de transmisión. El objetivo de este proyecto es desarrollar un nuevo sistema para la vigilancia molecular de la transmisión de MTB conciliando la alta discriminación aportada por la secuenciación de genoma completo (WGS) con la rapidez y transferibilidad inherente a los diseños basados en PCR. La estrategia se evaluará en diferentes nodos nacionales e internacionales que representen poblaciones i) estables, con escasa inmigración y cepas endémicas, ii) cambiantes, con alto porcentaje de inmigración y de importación de cepas, iii) vulnerables (marginales, penitenciarias), y iv) con importación y/o transmisión potencial de cepas multirresistentes (MDR) o de cepas de alta transmisibilidad. Se desarrollarán PCRs dirigidas a SNPs específicos, identificados mediante WGS, de las cepas catalizadoras de estos eventos de transmisión más relevantes. Los ensayos optmizados serán transferidos a los laboratorios locales para valorar el impacto derivado de su implantación in situ. La caracterización posterior por WGS de los aislados de MTB identificados por la nueva estrategia permitirá acceder a información no revelada por las estrategias convencionales, como la definición de la cronología de la transmisión, la existencia potencial de subclusters, asi como la presencia de casos supertransmisores. Por último, se estudiará la adquisición de variabilidad y de adaptación de MTB en circunstancias especiales que se esperan identificar en algunos de los nodos en estudio, tales como transmisiones prolongadas, demoras diagnósticas, tratamientos subóptimos y adquisición de resistencias.

tuberculosis
transmisión
secuencia masiva
secuenciación de genoma completo
reacción en cadena de la polimerasa específicas
PCR específicas
vigilancia multinodal descentralizada
variabilidad
cepas multirresistentes