Proyecto GENERACION: Estudio GENEtico de mutaciones RAras en el ictus isquémico y creación de un score clínico-genético de predicCION de riesgo

Resumen del proyecto

El ictus isquémico tiene un componente genético de riesgo que se sitúa entorno al 37%. A pesar de los estudios realizados con Genome Wide Association studies (GWAs) únicamente se ha descubierto el 5-10% del riesgo genético. Una de las posibles causas puede ser la presencia de mutaciones exónicas de baja frecuencia, mutaciones raras, difíciles de detectar por parte de los antiguos GWAs. Objetivos: 1-En uno de los mayores estudios genéticos realizados en el ictus (n=3.100) analizaremos mutaciones exónicas raras en el ictus isquémico. 2-Realizaremos un score para predecir el riesgo de ictus mediante variables clínicas, mutaciones raras y polimorfismos genéticos asociados a ictus. Metodología del proyecto: Analizaremos 3.100 casos y controles con el array Infinium HumanExonCore Beadchip (Illumina) capaces de detectar 250.000 mutaciones exónicas raras y 250.000 polimorfismos comunes. Realizaremos imputación de datos utilizando los datos del proyecto 1000Genomes. Las mutaciones raras y los polimorfismos asociados a ictus (p<10E-08) se replicarán en dos nuevas cohortes una de 4.000 ictus y controles de nacionalidad española y otra cohorte internacional de 74.393 ictus y controles. Los scores se realizarán mediante nuevas técnicas de Machine Learning. Analizaremos la funcionalidad de las mutaciones y polimorfismos replicados mediante software GUILD, DisGEnet, y los datos de expresión del proyecto Hapmap. El score clínicogenético generado se validará en tres cohortes prospectivas de 1.473, 976 y 800 sujetos con seguimiento de 6 años. Se estudiará si el score puede predecir los sujetos con riesgo elevado de sufrir un ictus.

Palabras clave

ictus isquémico
genética
estudio de asociación de genoma completo
GWAS
mutaciones

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2016 - 31/12/2018

Investigador Principal

FERNANDEZ CADENAS, ISRAEL

Centro beneficiario

FUNDACION MUTUA DE TERRASSA

Centro de realización

FUNDACION MUTUA DE TERRASSA

Comunidad Autónoma

CATALUÑA

Provincia

BARCELONA

Financiación

87,725 €