Análisis global del tratamiento prolongado con azitromicina en el microbioma y metaboloma de pacientes EPOC grave y exacerbaciones frecuentes. Identificación de biomarcadores sistémicos

Resumen del proyecto

Objetivos: 1) Estudiar el efecto que produce el tratamiento con azitromicina sobre: 1.1. la microbiota pulmonar y gastrointestinal; 1.2. los marcadores inflamatorios a nivel pulmonar y sistémico; 1.3. el metaboloma y/o proteoma a nivel pulmonar, sistémico y gastrointestinal; 2) Control microbiológico convencional de los cambios en la microbiota respiratoria con énfasis en cepas resistentes a azitromicina y en cepas persistentes; 3) Identificación y caracterización de rasgos de evolución adaptativa en cepas respiratorias persistentes mediante secuenciación genómica y análisis de polimorfismos; 4) Integración de la información -ómica y clínica obtenida mediante Biología de Sistemas para correlacionar los cambios observados en 1), 2) y 3) con la efectividad del tratamiento, e identificar biomarcadores de fallo o éxito terapéutico. Metodología: Estudio observacional, prospectivo y multicéntrico. Se valorará el efecto del tratamiento prolongado con azitromicina (0, 3 y 12 meses) en muestras de esputo, heces y sangre obtenidas de 40 pacientes EPOC con exacerbaciones frecuentes. Se estudiarán los cambios producidos en el microbioma mediante secuenciación, en el metaboloma mediante espectrometría de masas y Resonancia Magnética Nuclear (RMN), y en expresión de proteínas en heces mediante iTRAQ. Asimismo, se identificarán los cambios en marcadores inflamatorios mediante ELISA. Se evaluará la adquisición de cepas bacterianas resistentes a azitromicina y se caracterizarán los mecanismos de resistencia. Se estudiarán mediante Next Generation Sequencing las cepas persistentes aisladas de muestras de esputo en fase estable y exacerbación. Finalmente, se generarán modelos matemáticos que integrarán todas las variables mediante Biología de Sistemas para generar una visión global de los cambios que produce el tratamiento con azitromicina en pacientes EPOC grave con exacerbaciones frecuentes.

Palabras clave

enfermedad pulmonar obstructiva crónica
EPOC
azitromicina
pato adaptación bacteriana
biología de sistemas
microbioma
metaboloma
multicéntrico

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2017 - 31/12/2019

Investigador Principal

MARTI MARTI, SARA

Centro beneficiario

CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED (CIBER)

Centro de realización

HOSPITAL DE BELLVITGE

Comunidad Autónoma

CATALUÑA

Provincia

BARCELONA

Financiación

110,715 €