Serotipos no tifoideos de Salmonella enterica con resistencias emergentes y/o multirresistentes en la cornisa cantábrica: Análisis genómico y capacidad de dispersión de la resistencia

Resumen del proyecto

El presente proyecto coordinado pretende ampliar nuestros conocimientos sobre la resistencia en serotipos no tifoideos de Salmonella enterica obtenidos de muestras clínicas y alimentos en Asturias, Cantabria y País Vasco durante el periodo 2012-2018. Trabajando en colaboración con seis Hospitales, tres Laboratorios de Salud Pública y con el Centro Nacional de Microbiología, estudiaremos aislados multirresistentes y/o resistentes a fluoroquinolonas, cefalosporinas de amplio espectro, carbapenémicos y colistina. Se llevará a cabo la secuenciación de genomas completos. El análisis in silico, complementado con inspección manual y trabajo experimental, permitirá determinar la secuencia tipo (ST) e identificar genes de resistencia y virulencia y establecer su entorno genético. Se determinará la correlación entre el fenotipo de resistencia y el genotipo inferido in silico, para evaluar la posible aplicación de la genómica como herramienta de diagnóstico. Se llevará a cabo la caracterización de plásmidos de resistencia y se determinará el papel de S. enterica como posible vehículo de transmisión de resistencia a otras enterobacterias. Finalmente, se realizará un estudio filogenético y se investigará la correlación entre linajes/clones, resistencia y otras características de los aislados. El estudio aportará información relevante acerca de la epidemiología de la resistencia en los serotipos no tifoideos de S. enterica que están circulando en la cornisa cantábrica y situarla en el contexto de España.

Palabras clave

Salmonella enterica
resistencia
genómica
plásmido
fluoroquinolona
cefalosporina de amplio espectro
carbapenémico
colistina

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2018 - 31/12/2020

Investigador Principal

RODICIO RODICIO, MARIA ROSARIO

Centro beneficiario

UNIVERSIDAD DE OVIEDO

Centro de realización

FACULTAD DE MEDICINA DE OVIEDO

Comunidad Autónoma

Principado de Asturias

Provincia

Asturias

Financiación

88,330 €