Medicina de precisión en la predicción del riesgo a cáncer colorrectal en pacientes con diagnóstico genético de síndrome de Lynch

Resumen del proyecto

Objetivos: , O1.- Identificar y caracterizar factores genéticos modificadores de la penetrancia. , O2.- Analizar la microbiota intestinal y su asociación con el desarrollo de pólipos y CCR en individuos sanos con diagnóstico genético de síndrome de Lynch (SL). , O3.- Analizar la posible asociación de los modificadores genéticos de la penetrancia identificados con la microbiota intestinal en individuos con diagnóstico genético de SL. , Metodología: , O1- Se estudiarán los exomas de un total de 70 individuos con diagnóstico genético de SL y fenotipos extremos, como fase de identificación de posibles factores genéticos modificadores de la penetrancia (serie de test). Los resultados serán validados en una segunda serie independiente con 100 casos analizando exclusivamente los factores genéticos identificados en la primera fase. O2.- Se realizarán estudios de metagenómica 16S para el análisis de la microbiota de 580 muestras de heces de 116 individuos sanos y con diagnóstico genético de SL. Se analizará la estructura de la comunidad bacteriana (composición, riqueza y diversidad), el análisis de componentes principales, variabilidad temporal intraindividual y variabilidad entre grupos (sanos e individuos con eventos incidentales asociados con el SL). O3.- Análisis combinado de los resultados de factores genéticos y de la microbiota y su asociación con los grupos de individuos a riesgo afectos y no afectos.

Palabras clave

síndrome de Lynch
microbiota
exoma
factor modificador de la penetrancia

Periodo de ejecución

01/01/2018 - 31/12/2020

Investigador Principal

SOTO MARTINEZ, JOSE LUIS

Centro beneficiario

FUNDACION PARA EL FOMENTO DE LA INV. SANITARIA Y BIOMEDICA DE LA COMUNIDAD VALENCIANA (FISABIO)

Centro de realización

HOSPITAL GENERAL DE ELCHE

Comunidad Autónoma

Comunidad Valenciana

Provincia

Alicante/Alacant

Financiación

123,420 €