Estudio transcriptómico de la demencia frontotemporal para la comprensión de sus bases moleculares e identificación de biomarcadores que reflejen su sustrato neuropatológico in vivo.

Resumen del proyecto

La demencia frontotemporal (DFT) es una entidad clínica, neuropatológica y genéticamente heterogénea. En la mayoría de los casos es imposible determinar su sustrato patológico in vivo. Numerosos hallazgos indican de forma fehaciente que el metabolismo del ARN (transcriptoma) se halla alterado. No obstante, no existe ningún estudio que caracterice, de forma global y detallada, el transcriptoma de tejido cerebral afecto por la enfermedad. Los exosomas son vesículas excretadas por las células al medio, que están presentes en la mayoría de fluidos corporales y contienen, entre otras moléculas, tránscritos que son transportados a los distintos compartimentos del organismo. OBJETIVOS: Caracterizar, mediante técnicas de secuenciación de segunda generación, el transcriptoma completo (que incluye todas las formas de ARN) de tejido cerebral postmortem de los distintos subtipos patológicos de la DFT, para dilucidar isoformas específicas que puedan ser utilizadas como biomarcadores in vivo del proceso patológico subyacente al fenotipo clínico, a partir del estudio de exosomas contenidos en el líquido cefalorraquídeo (LCR). METODOLOGÍA: Se utilizarán técnicas de enriquecimiento específicas para capturar todas las especies de ARN (codificante y no codificante, de gran y pequeño tamaño) de córtex frontal de pacientes con confirmación neuropatológica de degeneración lobular frontotemporal (FTLD-TAU (n=10), FTLD-TDP (n=10) y FTLD-FUS (n=7), y controles (n=10). Los datos brutos serán evaluados mediante herramientas bioinformáticas de análisis de ARN desarrolladas recientemente. Los tránscritos que se hallen alterados en alguno de los subtipos serán mapeados con técnicas de hibridación in situ en tejido cerebral. Finalmente, la expresión de estos mismos candidatos serán evaluados en la fracción exosomal de LCR de pacientes con diferentes subtipos clínicos de DFT.

Palabras clave

demencia frontotemporal
transcriptoma
ultrasecuenciación
biomarcador
exosoma
líquido cefalorraquídeo

Periodo de ejecución

01/01/2019 - 31/12/2021

Investigador Principal

CLARIMON ECHAVARRIA, JORDI

Centro beneficiario

IIB-SANT PAU. INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL SANTA CRUZ Y SAN PABLO

Centro de realización

IIB-SANT PAU. INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL SANTA CRUZ Y SAN PABLO

Comunidad Autónoma

Cataluña

Provincia

Barcelona

Financiación

135,520 €