El objetivo general del proyecto es la investigación e identificación de los determinantes genéticos del hipopituitarismo congénito (HIPC) mediante la aplicación de técnicas de secuenciación masiva de última generación (NGS): secuenciación integral del exoma (WES) y de análisis genómico mediante SNParray.Objetivos específicos: 1) Investigar e identificar los determinantes genéticos del hipopituitarismo congénito (HIPC) en una cohorte de 110 tríos familiares con deficiencia combinada de hormonas hipofisarias (DCHH; n=30), hipogonadismo hipogonadotropo congénito (HHC; n=30), displasia septo-óptica (DSO; n=30) o holoprosencefalia (HPE; (n=20) sin defecto molecular conocido mediante: a) Secuenciación integral del exoma (WES) de los tríos familiares y b) Análisis genómico mediante SNP-array de los 110 pacientes índices, para investigar la presencia de CNVs no detectables mediante NGS. 2) Investigar y determinar la incidencia de etiología genética multifactorial y la frecuencia de herencia oligogénica en las cohortes de DCHH, HHC, DSO e HPE reclutadas mediante la determinación de la acumulación y combinación de variantes y mutaciones en las distintas vías de señalización implicadas en el desarrollo hipotálamo-hipofisario. 3) Establecer las correlaciones genotipo/fenotipo entre la combinación de variantes/mutaciones identificadas en las distintas vías y el fenotipo clínico de los pacientes; 4) Mejorar cualitativa- y cuantitativamente el diagnóstico molecular de los pacientes con HIPC.Métodos: La secuenciación integral el exoma se realizará en los 110 tríos familiares con el kit Agilent SureSelect Human All Exon V6 (58M), para la captura y enriquecimiento de los exomas con una cobertura media de 100x, utilizando librerías de ADN con insertos de 180-280pb en una plataforma HiSeq 4000 (paired end 150 bp) de Illumina. El análisis genómico mediante SNP-array se realizará con el chip Infinium Omni-Express-24+ v1.4 Bead Chip de Illumina en una plataforma HiScan.
hipopituitarismo congénito
displasia septoóptica
hipogonadismo hipogonadotrópico
deficiencia de hormonas hipofisarias
holoprosencefalia
secuenciación integral del exoma
secuenciación de exoma completo
array SNP
matriz SNP
01/01/2019 - 31/12/2021
CAMPOS BARROS, ANGEL
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL LA PAZ
INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL UNIVERSITARIO LA PAZ (IDIPAZ)
Comunidad de Madrid
Madrid
123,420 €