La reducción de costes y la simplificación del análisis de la secuenciación masiva, han aproximado la genómica al estudio de la tuberculosis, aunque no se ha logrado aún su implementación en el Sistema Nacional de Salud. Este proyecto pretende integrar la genómica en la optimización del control de la TB, en sus vertientes de diagnóstico, tratamiento y vigilancia de la transmisión. En el bloque diagnóstico se definirá una red entre 12 hospitales que abordará la secuenciación de genoma completo (WGS) sobre cultivos primarios positivos, con el fin de simultanear la identificación precoz de Mycobacterium tuberculosis y la obtención del perfil completo de mutaciones de resistencia a fármacos de primera y segunda línea. En el apartado de vigilancia de la transmisión se aplicará una estrategia adaptada, basada en el desarrollo de PCRs específicas dirigidas a SNPs marcadores de cepa obtenidos del análisis de WGS. Esta estrategia se desarrollará en el seno de una red que agrupa a 5 nodos de 5 CCAA y 4 internacionales para dar respuesta a cuatro retos prioritarios de vigilancia: monitorización de cepas en transmisión activa, evaluación del impacto y seguimiento de cepas inéditas importadas, activación precoz de alerta frente a brotes y vigilancia de eventos de distribución transnacional de cepas multirresistentes entre Rusia, Perú y Marruecos y Europa.

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