BJETIVOS: Estudiar en la Fibrosis quística (FQ) el impacto de la infección respiratoria vírica en el microbioma bacteriano respiratorio e intestinal:1) Analizar la composición del microbioma en la FQ estable, 2) Determinar los cambios del microbioma asociados a la infección vírica respiratoria, y la patogenicidad ligada a estos cambios. 3) Determinar la persistencia temporal de las modificaciones del microbioma, después de una infección vírica. 4) Identificar los cambios en el patrón inflamatorio respiratorio asociados a la infección vírica, y su relación con la composición del microbioma.5) Determinar la correlación entre el microbioma y la evolución de la enfermedad después de una infección vírica y 6) Identificar la información que aporta el análisis del viroma respiratorio, en estabilidad y en exacerbación por infección vírica, adicional a la virología convencional. Secundarios: Comparar el microbioma bacteriano de vía aérea supraglótica (lavado nasal, aspirado orofaríngeo) e infraglótica (esputo) en situación de estabilidad y durante la exacerbación por infección vírica. METODOS: Se creará una cohorte de pacientes FQ en las consultas de pedriatría y adultos. Se recogerán mensualmente muestras de aspirado nasal (N), aspirado orofaríngeo (OP), esputo (E) y heces (H) en estabilidad (Septiembre-Abril). El mismo set de muestras se recogerán en el momento de la exacerbación vírica y en las 3 semanas posteriores. Se determinará el microbioma por microbiología convencional y amplificación y secuenciación de 16S rRNA. La metagenómicas funcional y resistoma se determinará mediante secuenciación shotgun. Los virus respiratorios se identificarán mediante nested-PCR y lectura en microarray y estudios de viroma por secuenciación Shotgun, además se determinarán marcadores de respuesta inmune (IL1b, IL8, IL12, IL17,EN) (LUMINEX, ELISA). Finalmente, todos los datos se integrarán mediante biología de sistemas

fibrosis quística
exacerbación viral
microbioma
metagenómica
viroma
resistoma