Deconvolucionando poblaciones genómicas e inmunes para combatir la heterogeneidad en el cáncer de mama metastático

Resumen del proyecto

La metástasis es la principal causa de muerte asociada al cáncer de mama. La heterogeneidad del tumor es crítica en el proceso metastásico y afecta la progresión del cáncer de mama. En la clínica, es evidente que existe una notable heterogeneidad en el comportamiento tumoral entre pacientes con cáncer de mama con el mismo tipo de tumor y entre diferentes regiones tumorales en el mismo paciente. Estes últimos se manifiestan generalmente como respuestas diferenciales radiológicas (RDR) a la terapia. Hemos hipotetizado que RDR dentro y entre las metástasis es una consecuencia de la heterogeneidad del microambiente tumoral e inmune. Combinaremos el perfil multimodal de múltiples metástasis espacialmente diseminadas (autopsias de pacientes con cáncer de mama metastásico letal) junto con el análisis sistemático clínico-radiológico proveniente de diferentes órganos de los mismos pacientes. Caracterizaremos i) la colección de alteraciones genómicas somáticas de metástasis, cánceres primarios y ADN tumoral circulante (ctDNA) de fluidos corporales (secuenciación completa del exoma, shallow whole genome sequencing, secuenciación ultra profunda para validación de mutaciones y secuenciación ctDNA; ii) el microambiente inmune - se deconvolucionarán los linfocitos infiltrantes de tumor de depósitos metastásicos y cánceres primarios (RNAseq, análisis de IHC y secuenciación de receptores de células T -TCR- derivados de múltiples metástasis y tumores primarios de cada caso; iii) Cuantificaremos la respuesta radiológica en cada lesión durante el curso de las terapias y determinaremos la relación de la heterogeneidad tumoral e inmune del microambiente observada a través de análisis radiológicos. Esto deconvulocionará los cambios en los microambientes genómicos e inmune del tumor que están impulsando la progresión y la respuesta de metástasis a órganos específicos dentro de cada paciente con cáncer de mama.

Palabras clave

cáncer de mama metastásico
heterogeneidad tumoral
genómica
transcriptómica
microambiente tumoral
microambiente inmune
respuesta diferencial radiológica

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2019 - 31/12/2021

Investigador Principal

DE MATTOS ARRUDA, LETICIA

Centro beneficiario

FUNDACION IRSICAIXA

Centro de realización

FUNDACION IRSICAIXA

Comunidad Autónoma

Cataluña

Provincia

Barcelona

Financiación

123,420 €