Análisis del transcriptoma mediante RNA-Seq en pacientes con patología neuromuscular no resuelta tras secuenciación de exoma: optimización del algoritmo diagnóstico.

Resumen del proyecto

Las enfermedades neuromusculares constituyen un grupo heterogéneo de patologías de causa genética y naturaleza progresiva que muestran como característica principal la debilidad muscular. Alrededor del 50% de los casos debutan en la edad infantil. A pesar de que las técnicas de secuenciación masiva han incrementado exponencialmente nuestra capacidad para identificar las variantes genéticas responsables de estas enfermedades, alrededor del 50% de los pacientes no obtienen un diagnóstico molecular completo y preciso (resultados obtenidos en el FIS PI15/01898 con 244 pacientes estudiados mediante un panel de 115 genes de patología neuromuscular de diseño propio, exoma clínico y exoma completo, actualmente en curso ). El objetivo de este trabajo es incorporar, testar y validar la secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq) como abordaje de segunda línea para el diagnóstico molecular de los pacientes estudiados en el FIS PI15/01898 con enfermedades neuromusculares hereditarias, que no hayan obtenido el diagnóstico genético mediante la secuenciación de paneles de genes dirigidos y/o secuenciación de exoma completo. Mediante RNA-Seq se estudiarán: 1) Los niveles de expresión génica, pudiendo así identificarse genes (conocidos o nuevos) con expresión aberrante que puedan ser la causa de la enfermedad, 2) Los patrones de splicing alternativo que puedan causar inserción y/o deleción de zonas codificantes dando lugar a tránscritos no funcionales y 3) La expresión monoalélica en genes autosómicos candidatos y que presenten herencia recesiva con una única variante identificada.

Palabras clave

enfermedad neuromuscular
NGS
secuenciación de nueva generación
SNG
RNA-Seq
secuenciación de ARN
secuenciación de RNA

Periodo de ejecución

01/01/2019 - 31/12/2021

Investigador Principal

GALLANO PETIT, MARIA PIA

Centro beneficiario

IIB-SANT PAU. INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL SANTA CRUZ Y SAN PABLO

Centro de realización

IIB-SANT PAU. INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL SANTA CRUZ Y SAN PABLO

Comunidad Autónoma

Cataluña

Provincia

Barcelona

Financiación

123,420 €