Las paraparesias espásticas hereditarias y las ataxias cerebelosas hereditarias son dos grupos de enfermedades genéticas neurodegenerativas que comparten características fenotípicas y genes causales. Aunque el diagnóstico de estas enfermedades ha mejorado recientemente gracias a los métodos de secuenciación de nueva generación, y especialmente gracias a la secuenciación de exoma, alrededor del 50% de los pacientes permanecen sin diagnóstico. En este proyecto nuestro objetivo es mejorar el diagnóstico molecular de estas enfermedades, usando dos estrategias complementarias de secuenciación NGS en una cohorte de pacientes cuidadosamente seleccionada. Por una parte, usaremos secuenciación de genoma “long-read” para detectar anomalías estructurales complejas y expansiones de motivos repetitivos, dos tipos de mutaciones prevalentes en enfermedades neurológicas. Por otra parte, usaremos secuenciación del transcriptoma (RNA-seq) para detectar anomalías en la expresión o “splicing” usando ARN extraído de distintos tejidos de pacientes (fibroblastos primarios, o bien fibroblastos reprogramados a linajes neuronales). Validaremos el rol patogénico de las variantes candidatas mediante estudios funcionales usando muestras de los pacientes, o mediante métodos in vitro. En el caso de nuevos genes candidatos, se generarán líneas celulares neuronales (motoneurona o cerebelar) derivadas de iPSC a partir de fibroblastos de los pacientes. Los resultados de este proyecto aumentarán especificamente el conocimiento sobre la patogénesis de las paraparesias y ataxias cerebelosas hereditarias, y a nivel global contribuirán fuertemente a la mejora de los métodos de diagnóstico genético y tasa diagnóstica de estos trastornos hereditarios del movimiento.

paraparesias espásticas
ataxias cerebelosas
secuenciación long-read
transcriptoma
iPSC