Las inmunodeficiencias primarias (IDPs) constituyen un grupo de enfermedades muy heterogéneas des del punto de vista clínico, inmunológico y genético. La identificación de genes causantes de IDPs ha experimentado un auge importante en los últimos años y actualmente supera los 400. Indudablemente las tecnologías de secuenciación masiva (NGS, del inglés next generation sequencing) han tenido un papel fundamental en el descubrimiento de nuevos genes asociados a IDPs. Pero el rendimiento diagnóstico usando las tecnologías NGS habitualmente disponibles en las unidades de diagnóstico genético (paneles y whole exome secuencing, WES) no supera normalmente el 50%. Por ello, hay que aplicar nuevas aproximaciones para reducir esta brecha diagnóstica. El objetivo general de este proyecto es la identificación de nuevas bases genéticas de las inmunodeficiencias primarias mediante el análisis integrado de perfiles genómicos y transcriptómicos. En este proyecto seleccionaremos pacientes (n=25) con un diagnóstico clínico de IDP pero sin diagnóstico genético conclusivo después de haber realizado WES. A estos pacientes les aplicaremos la siguiente metodología: 1-Secuenciación del genoma completo (WGS, del inglés whole genome sequencing) de los pacientes y sus progenitores (trios): Se realizará un primer análisis de los datos de WGS. 2-Secuenciación del transcriptoma de sangre periférica (mediante la técnica RNAseq) de los pacientes y controles seleccionados. 3-Análisis integrado de los datos de WGS y RNAseq: Primero se analizarán los datos de RNAseq para identificar alteraciones relacionadas con expresión aberrante, splicing aberrante o expresión mono-alélica. En base a los hallazgos relevantes, se revisarán los datos de WGS para encontrar variantes potencialmente patogénicas que puedan explicar las alteraciones del RNAseq y, en último término, el fenotipo clínico del paciente. Los datos generados en este proyecto tendrán un impacto inmediato en los pacientes.

Inmunodeficiencas primarias
enfermedades raras
bases genéticas
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