Análisis multiómico unicelular para agrupar pacientes con nefritis lúpica según la respuesta clínica: hacia la medicina de precisión en nefritis lúpica

Resumen del proyecto

La afectación renal afecta a un 50% de los pacientes con Lupus Eritematoso Sistémico y a pesar de las mejoras en el tratamiento, todavía un 20% de los pacientes progresan a insuficiencia renal crónica. La respuesta al tratamiento convencional es subóptima, en parte debido a la heterogeneidad molecular y la naturaleza compleja de la enfermedad. Las técnicas ómicas usadas hasta ahora nos aportan información parcial ya que se centran solamente en el estudio de ARNm o proteína. El REAP-seq permite medir de forma simultánea los niveles de ARNm y proteína en una única célula por lo que puede ser fundamental para caracterizar molecularmente y poder clasificar mejor a estos pacientes. OBJETIVO: Estratificar a los pacientes con nefritis lúpica (NL) basándonos en la respuesta al tratamiento convencional mediante la técnica de REAP-seq para encontrar “clusters” de pacientes relacionados con la respuesta clínica. METODOLOGIA: Se incluirán 30 pacientes con NL proliferativa tipo III-IV activa de los cuales 15 hayan sido tratados con micofenolato mofetil (MMF) y otros 15 con ciclofosfamida endovenosa (CY) como tratamiento de la práctica habitual y de los cuales la mitad en cada grupo hayan sido respondedores o no respondedores en función de los criterios de respuesta establecidos. En el momento del brote renal se obtendrán PBMCs y una biopsia renal y se obtendrá una segunda muestra postratamiento (1 año). Las muestras serán analizadas con la técnica REAP-seq para identificar diferencias en la expresión génica y proteica simultánea entre: 1) respondedores frente a no respondedores; 2) tratamiento con CY vs MMF; 3) LN no tratado frente al postratamiento; 4) muestras de sangre vs tejido. Realizaremos análisis de “clustering” jerárquico para agrupar los pacientes según la respuesta clínica. Los perfiles identificados se validarán usando muestras de orina/sangre/tejido en una nueva cohorte (n=50).

Palabras clave

nefritis lúpica
REAP-seq
cluster pacientes
respuesta tratamiento
medicina de precisión

Periodo de ejecución

01/01/2022 - 31/12/2024

Investigador Principal

JOSEFINA, CORTES HERNANDEZ

Centro beneficiario

FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION VALLE DE HEBRON

Centro de realización

INSTITUTO DE INVESTIGACION HOSPITAL UNIVERSITARIO VALLE DE HEBRON (VHIR)

Comunidad Autónoma

Cataluña

Provincia

Barcelona

Financiación

117,000 €