A pesar de los avances en los métodos genómicos de caracterización genética, un elevado número de pacientes con enfermedades mitocondriales OXPHOS (EM) no presentan un diagnóstico genético concluyente (un 30-60% de los casos descritos. Una de las razones por las que no se llega a un diagnóstico genético preciso es la priorización de variantes de significado clínico incierto (VCSI; en inglés VUS). Por otra parte, la correlación fenotipo-genotipo en las EM no es sencilla, ya que muchos genes mutados se asocian a fenotipos muy diferentes. Nuestro objetivo es ayudar a resolver estas necesidades clínicas no cubiertas en el campo de la EM, a) mejorando la caracterización genética de los pacientes con EM mediante el desarrollo y la evaluación de una plataforma de genómica funcional, y b) obteniendo información sobre el papel fisiopatológico de varios genes con funciones múltiples relacionados con el sistema OXPHOS (MTOxpLGs) y su contribución a la variabilidad fenotípica. Para este objetivo, identificaremos VUS mediante una reevaluación retrospectiva de +1100 pacientes con sospecha de EM estudiados genéticamente en nuestro grupo a través de proyectos anteriores y con una identificación prospectiva de nuevas VUS en pacientes con sospecha de EM; posteriormente, seleccionaremos los métodos de genómica funcional que se incluirán en la evaluación de la plataforma para evaluar dichas VUS, y los correlacionaremos con el tipo de variante genética, la función del gen y el tipo de herencia. El rendimiento de estos métodos se asociará a la viabilidad de su traslación al escenario del laboratorio clínico. Para el segundo objetivo, caracterizaremos las alteraciones mitocondriales y los defectos en la función no-OXPHOS en fibroblastos de piel cultivados derivados de pacientes con EM que presenten alelos patogénicos en 7 MTOxpLGs disponibles en nuestro laboratorio, y compararemos esos defectos con los analizados en células KO del gen correspondiente generados por tecnología CRISPR.

VSCI
GENOMICA
ENFERMEDADES MITOCONDRIALES
CRISPR
ENFERMEDADES RARAS