El objetivo principal de este proyecto es determinar el papel de la microbiota respiratoria (incluyendo también virus y hongos) en la evolución de los pacientes con Covid-9, que precisan o no ingreso. Para ello, se estudiará la composición de la microbiota, la colonización vírica y sus variantes, la evolución clínica y los síntomas postCOVID de todos los pacientes, así como la respuesta inflamatoria (Linfocitos, Dímero-D, Fibrinógeno, Ferritina e IL-6) y la progresión de la enfermedad (sobreinfección bacteriana, vírica o fúngica, necesidad de O2, de UCI o muerte relacionada) en el grupo de pacientes ingresados. Se trata de un estudio multicéntrico en la Comunidad Autónoma de Cantabria, en pacientes diagnosticados positivos a SARS-CoV-2 (mediante RT-qPCR), con y sin síntomas graves de la enfermedad, en los que se analizará la composición taxonómica de su microbiota respiratoria mediante el uso de las técnicas de secuenciación masiva (NGS), en diferentes fases de la infección: muestras de frotis nasofaríngeo recogidas al diagnóstico, y la siguiente muestra positiva si la hubiere a los 7-14 días de la primera y una tercera al alta de los pacientes ingresados. En pacientes ingresados en UCI se estudiará el lavado broncoalveolar a los tiempos de recogida. Se realizará una visita al año de seguimiento donde recogerán los síntomas clínicos postCovid y se tomará una muestra de frotis nasofaríngeo. La información obtenida de datos microbiológicos, clínicos, epidemiológicos y de pronóstico se integrará mediante minería de datos que permitan desarrollar modelos de predicción de la prognosis clínica de los pacientes y de mejora en el tratamiento.

Microbiota respiratoria
COVID-19
SARS-CoV-2
Pronóstico

Acción Estratégica en Salud (AES)