Caracterización funcional de variantes de significado incierto detectadas mediante NGS y análisis de exoma de pacientes diagnosticados de tubulopatía pero sin confirmación genética.

Resumen del proyecto

El desarrollo del proyecto Renaltube nos ha permitido a través de un portal web (www.renaltube.com) agrupar numerosos pacientes con tubulopatías, enfermedades consideradas raras por su baja prevalencia. El análisis clínico y molecular de estas patologías ha facilitado el conocimiento de los distintos fenotipos asociados, así como de la evolución a largo plazo y la correlación genotipo-fenotipo de las mismas. La caracterización molecular mediante la utilización de la tecnología NGS (secuenciación masiva) nos ha permitido realizar el diagnóstico genético confirmatorio en un gran número de pacientes. Sin embargo, en un porcentaje de estos pacientes hayamos variantes de significado incierto cuya patogenicidad debe ser demostrada mediante análisis funcionales. Por otra parte, en otro porcentaje de pacientes no se halla ninguna mutación en los genes asociados a su enfermedad. Objetivo 1.) Caracterización del mecanismo molecular de las variantes de significado incierto detectadas en los genes asociados con el síndrome de Bartter. Objetivo 2.) Secuenciación del exoma de nuestra cohorte de pacientes clínicamente diagnosticados, pero sin mutaciones en los genes asociados a su tubulopatía. Estudio de asociación de las variantes encontradas y su implicación en la enfermedad. Objetivo 3.) Trasladar el conocimiento científico adquirido con la web de estudio de tubulopatías primarias RenalTube en acciones dirigidas a fomentar la participación y conocer las necesidades reales de los pacientes afectos de síndrome de Bartter, diabetes insípida nefrogénica y las alteraciones del calcio. Metodología: Análisis de expresión, localización y tráfico de 8 variantes mediante cultivo en células MDCKII y análisis mediante Western Blot. Estudio genético de 36 pacientes con síndrome de Bartter, diabetes insípida y alteraciones del sensor del calcio mediante el secuenciador ION GENESTUDIO S5 SYSTEM con ION CHEF para el análisis del exoma.

Palabras clave

Tubulopatía
exoma
caracterización funcional

Periodo de ejecución

01/01/2022 - 31/12/2024

Investigador Principal

ALEJANDRO, GARCIA CASTAÑO

Centro beneficiario

ASOCIACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA BIOCRUCES BIZKAIA

Centro de realización

BIOCRUCES HEALTH RESEARCH INSTITUTE (IIS BIOCRUCES)

Comunidad Autónoma

Comunidad de Madrid

Provincia

Madrid

Financiación

67,000 €