En este proyecto partimos de la hipótesis de que la enfermedad celíaca (EC) tiene su propia firma de metilación específica de tipo celular, que aparece antes del inicio de la enfermedad, también en el antígeno leucocitario humano (HLA). Basándonos en nuestra experiencia en el campo, proponemos que estos patrones pueden ser útiles en el manejo clínico de la EC del adulto. En este contexto, el objetivo principal del presente proyecto es encontrar patrones de metilación del ADN dentro y fuera de la región HLA, que ayuden a diagnosticar formas atípicas de EC y a predecir casos de EC potencial que debutarán a corto/medio plazo. Para ello, obtendremos los patrones de metilación global de un total de 210 muestras de celiacos y controles, incluyendo casos atípicos de EC y muestras sanguíneas e intestinales. Para inferir la especificidad de tipo celular de las firmas de metilación intestinal, construiremos un panel de referencia de metilación específico de tipo celular del duodeno celíaco. Además, validaremos los sitios CpG diferencialmente metilados más predictivos en una colección independiente de muestras de sangre e intestino de EC potencial, mediante el uso de secuenciación dirigida de ADN tratado con bisulfito, y prestando especial atención a la región HLA. Finalmente, obtendremos los datos de genotipado de todos los participantes para inferir la independencia genotípica de las firmas epigenéticas identificadas.
Enfermedad Celiaca
Metilación del ADN
biomarcadores
diagnóstico
Genómica
Acción Estratégica en Salud (AES)
01/01/2022 - 31/12/2024
NORA, FERNANDEZ JIMENEZ
ASOCIACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA BIOCRUCES BIZKAIA
BIOCRUCES HEALTH RESEARCH INSTITUTE (IIS BIOCRUCES)
PAIS VASCO
BIZKAIA
72,700 €