Afinando el diagnóstico de la enfermedad celiaca: marcadores de metilación del ADN específicos de tipo celular

Resumen del proyecto

En este proyecto partimos de la hipótesis de que la enfermedad celíaca (EC) tiene su propia firma de metilación específica de tipo celular, que aparece antes del inicio de la enfermedad, también en el antígeno leucocitario humano (HLA). Basándonos en nuestra experiencia en el campo, proponemos que estos patrones pueden ser útiles en el manejo clínico de la EC del adulto. En este contexto, el objetivo principal del presente proyecto es encontrar patrones de metilación del ADN dentro y fuera de la región HLA, que ayuden a diagnosticar formas atípicas de EC y a predecir casos de EC potencial que debutarán a corto/medio plazo. Para ello, obtendremos los patrones de metilación global de un total de 210 muestras de celiacos y controles, incluyendo casos atípicos de EC y muestras sanguíneas e intestinales. Para inferir la especificidad de tipo celular de las firmas de metilación intestinal, construiremos un panel de referencia de metilación específico de tipo celular del duodeno celíaco. Además, validaremos los sitios CpG diferencialmente metilados más predictivos en una colección independiente de muestras de sangre e intestino de EC potencial, mediante el uso de secuenciación dirigida de ADN tratado con bisulfito, y prestando especial atención a la región HLA. Finalmente, obtendremos los datos de genotipado de todos los participantes para inferir la independencia genotípica de las firmas epigenéticas identificadas.

Palabras clave

Enfermedad Celiaca
Metilación del ADN
biomarcadores
diagnóstico
Genómica

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2022 - 31/12/2024

Investigador Principal

NORA, FERNANDEZ JIMENEZ

Centro beneficiario

ASOCIACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA BIOCRUCES BIZKAIA

Centro de realización

BIOCRUCES HEALTH RESEARCH INSTITUTE (IIS BIOCRUCES)

Comunidad Autónoma

PAIS VASCO

Provincia

BIZKAIA

Financiación

72,700 €