La candidiasis invasora sigue causando una elevada morbi-mortalidad. Se ha descrito que la candidiasis pueden ser causadas por la translocación de cepas endógenas que colonizan el tracto gastrointestinal, la piel y los tejidos de las mucosas, o por cepas exógenas causando brotes que conllevan un aumento de la transmisión paciente-paciente. Sin embargo, aún no ha quedado clara la frecuencia con que estos posibles orígenes dan lugar a la diseminación de Candida. La secuenciación del genoma completo ha entrado con fuerza en los laboratorios, permitiendo resolver estas cuestiones de relevancia clínica, sin embargo, su aplicación de la genómica en Candida es muy reducida. El presente proyecto está basado en la caracterización genotípica (genotipado con microsatélites) y genómica (secuenciación del genoma completo) de aislados de Candida spp procedentes de sangre y otras localizaciones de pacientes ingresados en hospitales de ocho países europeos. Se genotiparán los aislados recogidos de forma prospectiva (8 centros) y retrospectiva (H. Gregorio Marañón) y a aquellos aislados en cluster (genotipos que infectan a =2 pacientes) se someterán a secuenciación del genoma completo. El objetivo es validar el genotipado con microsatélites mediante el establecimiento de un punto de corte que indique el mínimo número de cambios que determine si dos aislados son iguales o diferentes y tratar de dar respuesta en relación a los aislados involucrados en cluster: a) si ciertos genotipos presentes en los hospitales que involucran a pacientes con candidemia (con y sin relación epidemiológica clara) son en realidad eventos de transmisión paciente-paciente; b) determinar si los pacientes infectados por genotipos más frecuentes en la naturaleza presentan mejor pronóstico; c) poder esclarecer si el foco de infección es el catéter o por el contrario es el tracto gastrointestinal.

Candida
microsatélites
cluster
secuenciación del genoma completo
transmisión paciente-paciente
pronóstico
foco de infección

Acción Estratégica en Salud (AES)