Estimas de riesgos poligénicos basadas en factores latentes con coherencia biológica identificados a partir de susceptibilidad genética compartida: aplicaciones en trastornos psiquiátricos

Resumen del proyecto

Los trastornos psiquiátricos son muy poligénicos, y gran parte de la predisposición genética es común a los distintos trastornos. El objetivo general del proyecto es la identificación y caracterización de factores latentes, coherentes desde el punto de vista biológico, subyacentes al riesgo genético a padecer un trastorno mental, así como el estudio de la aplicación de estimas de riesgos genéticos basados en estos factores como posibles biomarcadores genómicos en relación a diagnóstico y manifestación clínica de los trastornos psiquiátricos. Para ello, emplearemos la descomposición en valores singulares de una matriz general que incluya efectos de polimorfismos de un único nucleótido (SNP) sobre trastornos psiquiátricos (incluyendo trastornos por uso de drogas) y fenotipos relacionados (conductas internalizantes y externalizantes, fenotipos cognitivos, rasgos de personalidad, etc), estimados en estudios de asociación de genoma completo (GWAS), para caracterizar componentes principales (PC) implicados en psicopatología. También se emplearán matrices con fenotipos específicos, como trastornos psiquiátricos y fenotipos inmunológicos, entre otros. Los PC serán caracterizados biológicamente mediante análisis de enriquecimiento en función de la contribución de cada SNP a cada PC. Teniendo en cuenta esta contribución, generaremos modelos de riesgos poligénicos de cada PC (pcPGS). A partir de datos de genotipación a nivel genómico de muestras de trastornos por uso de drogas y alcohol, esquizofrenia, psicosis, trastornos afectivos y controles poblacionales (parte ya obtenidos, parte de muestras ya obtenidas que se genotiparán durante el proyecto y parte de nuevas muestras), estimaremos los pcPGS en estas muestras y analizaremos su utilidad en asociación con diagnóstico, con variables clínicas y ambientales, detección de interacciones, heterogeneidad clínica, o efecto diferencial en función del sexo/género.

Palabras clave

riesgo poligénico
genómica
biomarcador
diagnóstico
pronóstico
trastorno mentales

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2024 - 31/12/2026

Investigador Principal

JAVIER COSTAS COSTAS

Centro beneficiario

FUNDACION PUBLICA GALEGA INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA DE SANTIAGO DE COMPOSTELA

Centro de realización

INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA DE SANTIAGO DE COMPOSTELA (IDIS)

Comunidad Autónoma

GALICIA

Provincia

CORUÑA, A

Financiación

82,000 €