Diagnóstico de las especies del complejo M. tuberculosis y resistencia a los fármacos mediante MALDI-TOF proteico y lipídico y espectroscopia de infrarrojos (FTIR) usando técnicas de “Machine Learning”

Resumen del proyecto

Objetivos: Aplicación de Machine Learning en el análisis de los espectros lipídicos y de infrarrojos obtenidos con la espectrometría de masas lipídica (MALDI-TOF) y espectroscopia FTIR, respectivamente para: 1) Identificar y diferenciar las diversas especies más relevantes del complejo Mycobacterium tuberculosis (MTBC): M. tuberculosis, M. bovis (con sus subespecies y variedad BCG) y M. africanum; 2) Detectar los aislamientos del MTBC resistentes a la rifampicina, isoniazida y fluoroquinolonas. Metodología: a) Estudio multicéntrico (MALDITUB; 2024-2026) con dos centros beneficiarios y dos proyectos (1 y 2), en aislamientos del MTBC. El estudio se realizará en 10 centros de 7 CC AA de España. El presente proyecto 2 se llevará a cabo en 4 centros y será dirigido desde el Hospital General Universitario Gregorio Marañón (HGUGM); b) Se analizarán aislamientos de MTBC obtenidos retrospectiva y prospectivamente de todos los centros participantes (proyecto 1 y 2), incluyendo cepas resistentes a la rifampicina, isoniazida y fluoroquinolonas; c) Se caracterizarán todas las cepas a nivel de especie y mecanismos de resistencia a los fármacos antituberculosos más relevantes, mediante métodos moleculares (PCR-Hibridación reversa y secuenciación de los genes 16S rRNA, hsp65 y rpoB cuando sea preciso); d) Se estudiarán los espectros lipídicos obtenidos con el MALDI-TOF y los espectros infrarrojos obtenidos por espectroscopia FTIR; e) Análisis comparativo de los espectros mediante Machine Learnig aplicando dos procesos de entrenamiento y validación.

Palabras clave

MALDI-TOF
Tuberculosis
Machine Learning
antibiotic resistance

Convocatoria

Acción Estratégica en Salud (AES)

Periodo de ejecución

01/01/2024 - 31/12/2026

Investigador Principal

DAVID RODRIGUEZ TEMPORAL

Centro beneficiario

FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL GREGORIO MARAÑON

Centro de realización

INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA GREGORIO MARAÑON (IiSGM)

Comunidad Autónoma

MADRID

Provincia

MADRID

Financiación

38,000 €